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传染病病原监测信息系统主要以临床标本（特别是症候群病原标本)、环境样本、生物样品等为监测目标，旨在掌握新发、突发病原生物以及病原谱变化规律，帮助实现重点病原、新发病原所致疫情和生物安全事件的早期快速发现、溯源和风险评估。通过对接现有的或新建病原监测网络(含流感、脑炎、出血热、麻疹、脊灰等病原监测网络)、致病菌识别网为基础，实现第三方检测机构、其他部门相关实验室组成的病原微生物实验室网络，以新发、突发、急性、高致病性、输入性等病原为重点监测内容，实现辖区内相关实验室的标准化数据采集，实现“逢检必报”“逢阳直报”。支持数据实时推送至“数据中台”，实现数据的实时汇聚、共享。